2009 januárjában indult el az Apokrif irodalmi folyóirat hálózati kiadása, az Apokrif Online. A kezdetekben ez a felület elsősorban a nyomtatásban megjelent művek (késleltetett) újraközlésére, a folyóirat által szervezett események reklámozására és elsősorban a nyomtatott kiadásból kimaradt, ám a szerkesztők meglátása szerint megjelenésre méltó szövegek közlésére szolgált.
Nyerges Gábor Ádám így ír erről az első szám előszavában: “…bár egy folyóirat összeállítása minden (legalábbis minden említésre méltó) kiadvány esetében a szerkesztői értékrend lenyomata is, nem tartjuk kizárólagosnak a véleményünket, ahogy magunkat sem megfellebbezhetetlen orákulumok gyülekezetének. Ezért indul el hamarosan az Apokrif hálózati kiadása, amely olyan műveket is tartalmazni fog, amelyek bizonyos (terjedelmi vagy egyéb) okok miatt nem fértek be a nyomtatott verzióba, vagy csak nem tetszettek nekünk, mégis láttunk bennük fantáziát.”
A weboldal design-jáért és karbantartásáért indulása óta Tarcsay Zoltán felel, szerkesztője a kezdetektől a nyomtatott Apokrif főszerkesztője, Nyerges Gábor Ádám, 2012 januárjától szeptemberig Reichert Gáborral, onnantól Turi Mártonnal közösen. 2012 szeptemberében kezdődött meg az Apokrif Online megújulása, ekkor jött létre az önálló színházi, illetve képzőművészeti rovat (előbbi rovatvezetője Mihók Nóra Zsófia, utóbbié Barkóczi Flóra és veress dani). A honlap indulása óta folyamatosan egyre inkább elkülönül mind tartalmilag, mind jellegében a nyomtatott Apokriftől, immáron lényegében önálló, külön sajtófelületként üzemelve közöl szépirodalmi műveket, recenziókat, könyvajánlókat, irodalmi, színházi, képzőművészeti, zenei és filmkritikákat, interjúkat, programajánlókat, tudósításokat és évente két alkalommal tematikus netnapló/jegyzet-összeállításokat: az Ünnepi Könyvhét eseményeiről napi bontásban jelentkező, szubjektív naplókban számolnak be a folyóirat által felkért szerzők, míg a naptári évek végén amolyan szubjektív évösszegző netnaplókat írnak szerzőink az Évjárat rovat keretében. Folyóirat-olvasó című rovatunkban az Apokrif hasábjain indult és az éppen aktuálisan az Apokrif szerzői köréhez tartozó, akár a nyomtatott lapban, akár az online felületen rendszeresen publikáló szerzőink más folyóiratokban megjelent műveiből tallózva állítunk össze szubjektív ajánlót azon olvasóinknak, akik az Apokrif hasábjain kívül is kíváncsiak a lapban rendszeresen publikáló szerzők munkáira.